Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms