Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTIFO43310 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTIFO43310 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTIFO43310 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTIFO43310 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTIFO43310 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTIFO43310 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTIFO43310 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTIFO43310 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTIFO43310 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTIFO43310 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTIFO43310 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTIFO43310 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTIFO43310 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTIFO43310 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTIFO43310 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTIFO43310 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTIFO43310 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTIFO43310 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTIFO43310 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTIFO43310 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CTIFO43310 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTIFO43310 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTIFO43310 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTIFO43310 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTIFO43310 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTIFO43310 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTIFO43310 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTIFO43310 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTIFO43310 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTIFO43310 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTIFO43310 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTIFO43310 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTIFO43310 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTIFO43310 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTIFO43310 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTIFO43310 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTIFO43310 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTIFO43310 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTIFO43310 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTIFO43310 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTIFO43310 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTIFO43310 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTIFO43310 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTIFO43310 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTIFO43310 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTIFO43310 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTIFO43310 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTIFO43310 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTIFO43310 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTIFO43310 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTIFO43310 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTIFO43310 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTIFO43310 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTIFO43310 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CTIFO43310 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CTIFO43310 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CTIFO43310 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTIFO43310 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTIFO43310 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTIFO43310 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTIFO43310 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTIFO43310 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTIFO43310 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTIFO43310 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTIFO43310 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTIFO43310 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTIFO43310 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTIFO43310 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTIFO43310 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTIFO43310 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTIFO43310 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTIFO43310 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTIFO43310 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTIFO43310 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTIFO43310 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTIFO43310 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTIFO43310 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTIFO43310 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTIFO43310 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTIFO43310 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTIFO43310 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTIFO43310 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTIFO43310 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTIFO43310 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTIFO43310 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTIFO43310 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTIFO43310 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTIFO43310 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTIFO43310 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTIFO43310 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTIFO43310 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTIFO43310 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTIFO43310 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTIFO43310 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTIFO43310 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTIFO43310 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTIFO43310 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTIFO43310 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTIFO43310 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms