Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDC80O14777 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDC80O14777 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDC80O14777 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDC80O14777 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NDC80O14777 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDC80O14777 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDC80O14777 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDC80O14777 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDC80O14777 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDC80O14777 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDC80O14777 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDC80O14777 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDC80O14777 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDC80O14777 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDC80O14777 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDC80O14777 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDC80O14777 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDC80O14777 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDC80O14777 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDC80O14777 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDC80O14777 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDC80O14777 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDC80O14777 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDC80O14777 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDC80O14777 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDC80O14777 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDC80O14777 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NDC80O14777 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NDC80O14777 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NDC80O14777 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDC80O14777 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDC80O14777 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDC80O14777 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDC80O14777 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDC80O14777 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDC80O14777 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDC80O14777 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDC80O14777 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDC80O14777 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NDC80O14777 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDC80O14777 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDC80O14777 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDC80O14777 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDC80O14777 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDC80O14777 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDC80O14777 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDC80O14777 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NDC80O14777 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDC80O14777 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDC80O14777 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDC80O14777 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDC80O14777 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDC80O14777 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDC80O14777 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDC80O14777 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDC80O14777 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDC80O14777 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDC80O14777 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDC80O14777 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDC80O14777 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDC80O14777 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NDC80O14777 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NDC80O14777 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDC80O14777 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDC80O14777 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDC80O14777 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NDC80O14777 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDC80O14777 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDC80O14777 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDC80O14777 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDC80O14777 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDC80O14777 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDC80O14777 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDC80O14777 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDC80O14777 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDC80O14777 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDC80O14777 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDC80O14777 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDC80O14777 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDC80O14777 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDC80O14777 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDC80O14777 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NDC80O14777 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NDC80O14777 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NDC80O14777 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NDC80O14777 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NDC80O14777 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NDC80O14777 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NDC80O14777 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDC80O14777 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDC80O14777 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDC80O14777 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDC80O14777 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDC80O14777 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDC80O14777 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDC80O14777 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDC80O14777 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NDC80O14777 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NDC80O14777 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms