Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPEO14579 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPEO14579 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPEO14579 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPEO14579 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPEO14579 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
COPEO14579 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPEO14579 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPEO14579 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPEO14579 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPEO14579 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COPEO14579 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPEO14579 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPEO14579 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COPEO14579 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPEO14579 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPEO14579 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPEO14579 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPEO14579 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPEO14579 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPEO14579 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPEO14579 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPEO14579 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPEO14579 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPEO14579 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPEO14579 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPEO14579 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPEO14579 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPEO14579 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPEO14579 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPEO14579 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPEO14579 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COPEO14579 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPEO14579 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPEO14579 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPEO14579 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPEO14579 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPEO14579 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPEO14579 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPEO14579 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPEO14579 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPEO14579 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COPEO14579 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPEO14579 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPEO14579 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPEO14579 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPEO14579 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COPEO14579 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPEO14579 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPEO14579 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPEO14579 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPEO14579 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPEO14579 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPEO14579 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPEO14579 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPEO14579 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPEO14579 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPEO14579 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPEO14579 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPEO14579 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPEO14579 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COPEO14579 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPEO14579 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPEO14579 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPEO14579 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPEO14579 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPEO14579 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPEO14579 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPEO14579 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPEO14579 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPEO14579 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPEO14579 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPEO14579 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPEO14579 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPEO14579 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPEO14579 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPEO14579 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPEO14579 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPEO14579 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPEO14579 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPEO14579 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPEO14579 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPEO14579 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPEO14579 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPEO14579 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPEO14579 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPEO14579 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPEO14579 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPEO14579 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPEO14579 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPEO14579 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPEO14579 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPEO14579 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPEO14579 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COPEO14579 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPEO14579 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPEO14579 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPEO14579 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPEO14579 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPEO14579 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.1 ms