Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLOD2O00469 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLOD2O00469 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLOD2O00469 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLOD2O00469 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLOD2O00469 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLOD2O00469 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms