Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCRL2O00421 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCRL2O00421 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCRL2O00421 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms