Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QLW9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QLW9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QLW9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QLW9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QLW9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QLW9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QLW9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QLW9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QLW9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3QLW9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3QLW9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3QLW9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QLW9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QLW9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QLW9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QLW9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QLW9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QLW9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QLW9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QLW9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QLW9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QLW9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QLW9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QLW9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
J3QLW9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QLW9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QLW9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QLW9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QLW9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QLW9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QLW9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QLW9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QLW9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QLW9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QLW9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QLW9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QLW9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QLW9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QLW9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QLW9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QLW9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QLW9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QLW9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QLW9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QLW9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QLW9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QLW9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QLW9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QLW9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QLW9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QLW9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QLW9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QLW9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
J3QLW9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
J3QLW9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
J3QLW9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QLW9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QLW9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QLW9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QLW9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QLW9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QLW9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QLW9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QLW9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QLW9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QLW9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QLW9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QLW9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QLW9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QLW9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QLW9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QLW9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QLW9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QLW9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QLW9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QLW9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QLW9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QLW9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QLW9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
J3QLW9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QLW9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QLW9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QLW9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QLW9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QLW9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
J3QLW9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
J3QLW9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
J3QLW9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
J3QLW9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QLW9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QLW9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QLW9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QLW9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QLW9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QLW9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QLW9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QLW9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QLW9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QLW9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms