Protein–RNA interactions for Protein: F5GYI3

UBAP1L, Ubiquitin-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1LF5GYI3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
UBAP1LF5GYI3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
UBAP1LF5GYI3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
UBAP1LF5GYI3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
UBAP1LF5GYI3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
UBAP1LF5GYI3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
UBAP1LF5GYI3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
UBAP1LF5GYI3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
UBAP1LF5GYI3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
UBAP1LF5GYI3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
UBAP1LF5GYI3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
UBAP1LF5GYI3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
UBAP1LF5GYI3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
UBAP1LF5GYI3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
UBAP1LF5GYI3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
UBAP1LF5GYI3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
UBAP1LF5GYI3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
UBAP1LF5GYI3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
UBAP1LF5GYI3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
UBAP1LF5GYI3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
UBAP1LF5GYI3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
UBAP1LF5GYI3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
UBAP1LF5GYI3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
UBAP1LF5GYI3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
UBAP1LF5GYI3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
UBAP1LF5GYI3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
UBAP1LF5GYI3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
UBAP1LF5GYI3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
UBAP1LF5GYI3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
UBAP1LF5GYI3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
UBAP1LF5GYI3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
UBAP1LF5GYI3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
UBAP1LF5GYI3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
UBAP1LF5GYI3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBAP1LF5GYI3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
UBAP1LF5GYI3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
UBAP1LF5GYI3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
UBAP1LF5GYI3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
UBAP1LF5GYI3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
UBAP1LF5GYI3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
UBAP1LF5GYI3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
UBAP1LF5GYI3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
UBAP1LF5GYI3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
UBAP1LF5GYI3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
UBAP1LF5GYI3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
UBAP1LF5GYI3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
UBAP1LF5GYI3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
UBAP1LF5GYI3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms