Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROB1E7EW31 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PROB1E7EW31 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PROB1E7EW31 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PROB1E7EW31 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms