Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM49D1C9J1S8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM49D1C9J1S8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM49D1C9J1S8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49D1C9J1S8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49D1C9J1S8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms