Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZK1P1A8MUH7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZK1P1A8MUH7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZK1P1A8MUH7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZK1P1A8MUH7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZK1P1A8MUH7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZK1P1A8MUH7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZK1P1A8MUH7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZK1P1A8MUH7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZK1P1A8MUH7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZK1P1A8MUH7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZK1P1A8MUH7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDZK1P1A8MUH7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDZK1P1A8MUH7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZK1P1A8MUH7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDZK1P1A8MUH7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZK1P1A8MUH7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZK1P1A8MUH7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms