Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
STRCP1A6NGW2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
STRCP1A6NGW2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCP1A6NGW2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCP1A6NGW2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
STRCP1A6NGW2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
STRCP1A6NGW2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
STRCP1A6NGW2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms