Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
STRCP1A6NGW2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
STRCP1A6NGW2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCP1A6NGW2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCP1A6NGW2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
STRCP1A6NGW2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
STRCP1A6NGW2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
STRCP1A6NGW2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
STRCP1A6NGW2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
STRCP1A6NGW2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
STRCP1A6NGW2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
STRCP1A6NGW2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms