Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIPSLA2A3N6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIPSLA2A3N6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIPSLA2A3N6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIPSLA2A3N6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms