Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3KRW8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
J3KRW8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
J3KRW8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
J3KRW8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KRW8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KRW8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KRW8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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