Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOHLH1Q5JUK2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SOHLH1Q5JUK2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms