Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
J3KRW8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3KRW8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3KRW8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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