Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00205P59089 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms