Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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