Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD1Q15797 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1014.3 ms