Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCDHB5Q9Y5E4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB5Q9Y5E4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB5Q9Y5E4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB5Q9Y5E4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB5Q9Y5E4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB5Q9Y5E4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB5Q9Y5E4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB5Q9Y5E4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB5Q9Y5E4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms