Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3HQ9Y535 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3HQ9Y535 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3HQ9Y535 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3HQ9Y535 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3HQ9Y535 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3HQ9Y535 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3HQ9Y535 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3HQ9Y535 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3HQ9Y535 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3HQ9Y535 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3HQ9Y535 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3HQ9Y535 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3HQ9Y535 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3HQ9Y535 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3HQ9Y535 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3HQ9Y535 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3HQ9Y535 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3HQ9Y535 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3HQ9Y535 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3HQ9Y535 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3HQ9Y535 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3HQ9Y535 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3HQ9Y535 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3HQ9Y535 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3HQ9Y535 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3HQ9Y535 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms