Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B5

MTCL1, Microtubule cross-linking factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCL1Q9Y4B5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTCL1Q9Y4B5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MTCL1Q9Y4B5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MTCL1Q9Y4B5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MTCL1Q9Y4B5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MTCL1Q9Y4B5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTCL1Q9Y4B5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MTCL1Q9Y4B5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MTCL1Q9Y4B5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTCL1Q9Y4B5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTCL1Q9Y4B5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MTCL1Q9Y4B5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTCL1Q9Y4B5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTCL1Q9Y4B5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTCL1Q9Y4B5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTCL1Q9Y4B5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTCL1Q9Y4B5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTCL1Q9Y4B5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTCL1Q9Y4B5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms