Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVK-11Q9UQG0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-11Q9UQG0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-11Q9UQG0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-11Q9UQG0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-11Q9UQG0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-11Q9UQG0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-11Q9UQG0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-11Q9UQG0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-11Q9UQG0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-11Q9UQG0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-11Q9UQG0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms