Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGSF9BQ9UPX0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGSF9BQ9UPX0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGSF9BQ9UPX0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGSF9BQ9UPX0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGSF9BQ9UPX0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGSF9BQ9UPX0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IGSF9BQ9UPX0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
IGSF9BQ9UPX0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IGSF9BQ9UPX0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IGSF9BQ9UPX0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IGSF9BQ9UPX0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
IGSF9BQ9UPX0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IGSF9BQ9UPX0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IGSF9BQ9UPX0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IGSF9BQ9UPX0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IGSF9BQ9UPX0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IGSF9BQ9UPX0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
IGSF9BQ9UPX0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IGSF9BQ9UPX0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
IGSF9BQ9UPX0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms