Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF19Q9UMS4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF19Q9UMS4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF19Q9UMS4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF19Q9UMS4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF19Q9UMS4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms