Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNB3Q9ULL4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNB3Q9ULL4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PLXNB3Q9ULL4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXNB3Q9ULL4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLXNB3Q9ULL4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms