Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP2Q9UHC6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP2Q9UHC6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP2Q9UHC6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP2Q9UHC6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTNAP2Q9UHC6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTNAP2Q9UHC6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP2Q9UHC6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP2Q9UHC6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP2Q9UHC6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP2Q9UHC6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTNAP2Q9UHC6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms