Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA6Q9UF33 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA6Q9UF33 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHA6Q9UF33 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHA6Q9UF33 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHA6Q9UF33 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPHA6Q9UF33 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA6Q9UF33 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA6Q9UF33 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHA6Q9UF33 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHA6Q9UF33 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHA6Q9UF33 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHA6Q9UF33 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHA6Q9UF33 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHA6Q9UF33 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHA6Q9UF33 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHA6Q9UF33 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHA6Q9UF33 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms