Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWV4

C1orf123, UPF0587 protein C1orf123, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf123Q9NWV4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf123Q9NWV4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf123Q9NWV4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf123Q9NWV4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf123Q9NWV4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf123Q9NWV4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf123Q9NWV4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf123Q9NWV4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf123Q9NWV4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf123Q9NWV4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf123Q9NWV4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf123Q9NWV4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1orf123Q9NWV4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf123Q9NWV4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf123Q9NWV4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf123Q9NWV4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf123Q9NWV4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf123Q9NWV4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf123Q9NWV4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf123Q9NWV4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms