Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCLQ9NW38 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
FANCLQ9NW38 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FANCLQ9NW38 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms