Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM140Q9NV12 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM140Q9NV12 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TMEM140Q9NV12 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms