Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IL1RAPQ9NPH3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IL1RAPQ9NPH3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IL1RAPQ9NPH3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IL1RAPQ9NPH3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IL1RAPQ9NPH3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IL1RAPQ9NPH3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IL1RAPQ9NPH3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms