Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF3Q9H4W6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EBF3Q9H4W6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EBF3Q9H4W6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EBF3Q9H4W6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EBF3Q9H4W6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EBF3Q9H4W6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EBF3Q9H4W6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EBF3Q9H4W6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EBF3Q9H4W6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EBF3Q9H4W6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EBF3Q9H4W6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EBF3Q9H4W6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EBF3Q9H4W6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EBF3Q9H4W6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EBF3Q9H4W6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EBF3Q9H4W6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EBF3Q9H4W6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EBF3Q9H4W6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF3Q9H4W6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF3Q9H4W6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF3Q9H4W6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF3Q9H4W6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF3Q9H4W6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF3Q9H4W6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF3Q9H4W6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF3Q9H4W6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF3Q9H4W6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF3Q9H4W6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF3Q9H4W6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF3Q9H4W6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EBF3Q9H4W6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms