Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CELF4Q9BZC1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CELF4Q9BZC1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CELF4Q9BZC1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CELF4Q9BZC1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CELF4Q9BZC1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CELF4Q9BZC1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CELF4Q9BZC1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CELF4Q9BZC1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CELF4Q9BZC1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CELF4Q9BZC1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CELF4Q9BZC1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CELF4Q9BZC1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CELF4Q9BZC1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CELF4Q9BZC1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CELF4Q9BZC1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CELF4Q9BZC1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CELF4Q9BZC1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CELF4Q9BZC1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms