Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YTHDF1Q9BYJ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YTHDF1Q9BYJ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YTHDF1Q9BYJ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms