Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
YIPF4Q9BSR8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF4Q9BSR8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF4Q9BSR8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms