Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT2

UQCC2, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC2Q9BRT2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UQCC2Q9BRT2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCC2Q9BRT2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UQCC2Q9BRT2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCC2Q9BRT2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.4 ms