Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPA33Q99795 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPA33Q99795 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPA33Q99795 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPA33Q99795 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms