Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
RSF1Q96T23 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
RSF1Q96T23 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
RSF1Q96T23 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
RSF1Q96T23 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
RSF1Q96T23 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
RSF1Q96T23 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
RSF1Q96T23 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
RSF1Q96T23 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
RSF1Q96T23 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC47.26■■■■■ 5.16
RSF1Q96T23 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
RSF1Q96T23 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
RSF1Q96T23 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
RSF1Q96T23 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
RSF1Q96T23 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
RSF1Q96T23 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC47.18■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.14■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC47.13■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
RSF1Q96T23 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC47.13■■■■■ 5.13
RSF1Q96T23 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
RSF1Q96T23 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC47.11■■■■■ 5.13
RSF1Q96T23 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
RSF1Q96T23 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC47.08■■■■■ 5.13
RSF1Q96T23 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
RSF1Q96T23 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
RSF1Q96T23 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC47.07■■■■■ 5.13
RSF1Q96T23 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC47.06■■■■■ 5.12
RSF1Q96T23 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
RSF1Q96T23 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
RSF1Q96T23 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC47.04■■■■■ 5.12
RSF1Q96T23 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
RSF1Q96T23 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC47.01■■■■■ 5.12
RSF1Q96T23 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
RSF1Q96T23 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC47■■■■■ 5.11
RSF1Q96T23 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
RSF1Q96T23 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
RSF1Q96T23 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
RSF1Q96T23 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC46.96■■■■■ 5.11
RSF1Q96T23 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC46.96■■■■■ 5.11
RSF1Q96T23 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
RSF1Q96T23 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
RSF1Q96T23 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC46.94■■■■■ 5.11
RSF1Q96T23 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
RSF1Q96T23 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC46.93■■■■■ 5.1
RSF1Q96T23 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
RSF1Q96T23 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
RSF1Q96T23 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.91■■■■■ 5.1
RSF1Q96T23 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
RSF1Q96T23 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
RSF1Q96T23 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
RSF1Q96T23 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
RSF1Q96T23 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
RSF1Q96T23 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
RSF1Q96T23 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC46.86■■■■■ 5.09
RSF1Q96T23 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
RSF1Q96T23 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
RSF1Q96T23 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC46.83■■■■■ 5.09
RSF1Q96T23 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
RSF1Q96T23 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC46.82■■■■■ 5.09
RSF1Q96T23 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
RSF1Q96T23 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
RSF1Q96T23 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
RSF1Q96T23 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
RSF1Q96T23 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
RSF1Q96T23 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
RSF1Q96T23 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
RSF1Q96T23 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
RSF1Q96T23 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC46.77■■■■■ 5.08
RSF1Q96T23 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
RSF1Q96T23 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
RSF1Q96T23 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
RSF1Q96T23 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
RSF1Q96T23 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
RSF1Q96T23 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
RSF1Q96T23 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
RSF1Q96T23 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.73■■■■■ 5.07
RSF1Q96T23 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC46.73■■■■■ 5.07
RSF1Q96T23 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.73■■■■■ 5.07
RSF1Q96T23 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC46.73■■■■■ 5.07
RSF1Q96T23 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms