Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q80

DERL3, Derlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERL3Q96Q80 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DERL3Q96Q80 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DERL3Q96Q80 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DERL3Q96Q80 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms