Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VSIG2Q96IQ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSIG2Q96IQ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms