Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC35A4Q96G79 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC35A4Q96G79 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35A4Q96G79 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35A4Q96G79 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC35A4Q96G79 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC35A4Q96G79 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC35A4Q96G79 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC35A4Q96G79 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC35A4Q96G79 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms