Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIPC3Q8TF64 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GIPC3Q8TF64 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIPC3Q8TF64 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GIPC3Q8TF64 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms