Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DTX3LQ8TDB6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DTX3LQ8TDB6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DTX3LQ8TDB6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTX3LQ8TDB6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTX3LQ8TDB6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTX3LQ8TDB6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DTX3LQ8TDB6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DTX3LQ8TDB6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DTX3LQ8TDB6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DTX3LQ8TDB6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DTX3LQ8TDB6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DTX3LQ8TDB6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DTX3LQ8TDB6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DTX3LQ8TDB6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DTX3LQ8TDB6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DTX3LQ8TDB6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DTX3LQ8TDB6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DTX3LQ8TDB6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DTX3LQ8TDB6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DTX3LQ8TDB6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DTX3LQ8TDB6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DTX3LQ8TDB6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms