Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SPRYD3Q8NCJ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SPRYD3Q8NCJ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SPRYD3Q8NCJ5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SPRYD3Q8NCJ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SPRYD3Q8NCJ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SPRYD3Q8NCJ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SPRYD3Q8NCJ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SPRYD3Q8NCJ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SPRYD3Q8NCJ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SPRYD3Q8NCJ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SPRYD3Q8NCJ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SPRYD3Q8NCJ5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SPRYD3Q8NCJ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SPRYD3Q8NCJ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SPRYD3Q8NCJ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SPRYD3Q8NCJ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SPRYD3Q8NCJ5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms