Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AVL9Q8NBF6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AVL9Q8NBF6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AVL9Q8NBF6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AVL9Q8NBF6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms