Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC63Q8NA47 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC63Q8NA47 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC63Q8NA47 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC63Q8NA47 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC63Q8NA47 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms