Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ANKRD42Q8N9B4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ANKRD42Q8N9B4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ANKRD42Q8N9B4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ANKRD42Q8N9B4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ANKRD42Q8N9B4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ANKRD42Q8N9B4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ANKRD42Q8N9B4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ANKRD42Q8N9B4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ANKRD42Q8N9B4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ANKRD42Q8N9B4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ANKRD42Q8N9B4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ANKRD42Q8N9B4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ANKRD42Q8N9B4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ANKRD42Q8N9B4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ANKRD42Q8N9B4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ANKRD42Q8N9B4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD42Q8N9B4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD42Q8N9B4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD42Q8N9B4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD42Q8N9B4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD42Q8N9B4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD42Q8N9B4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD42Q8N9B4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD42Q8N9B4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms