Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
IGSF1Q8N6C5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
IGSF1Q8N6C5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
IGSF1Q8N6C5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
IGSF1Q8N6C5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
IGSF1Q8N6C5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
IGSF1Q8N6C5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
IGSF1Q8N6C5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
IGSF1Q8N6C5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
IGSF1Q8N6C5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
IGSF1Q8N6C5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
IGSF1Q8N6C5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
IGSF1Q8N6C5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
IGSF1Q8N6C5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
IGSF1Q8N6C5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
IGSF1Q8N6C5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
IGSF1Q8N6C5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
IGSF1Q8N6C5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
IGSF1Q8N6C5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
IGSF1Q8N6C5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
IGSF1Q8N6C5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
IGSF1Q8N6C5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
IGSF1Q8N6C5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
IGSF1Q8N6C5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
IGSF1Q8N6C5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
IGSF1Q8N6C5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
IGSF1Q8N6C5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
IGSF1Q8N6C5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
IGSF1Q8N6C5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
IGSF1Q8N6C5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
IGSF1Q8N6C5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
IGSF1Q8N6C5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
IGSF1Q8N6C5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
IGSF1Q8N6C5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
IGSF1Q8N6C5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
IGSF1Q8N6C5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
IGSF1Q8N6C5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
IGSF1Q8N6C5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
IGSF1Q8N6C5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
IGSF1Q8N6C5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
IGSF1Q8N6C5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
IGSF1Q8N6C5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
IGSF1Q8N6C5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
IGSF1Q8N6C5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
IGSF1Q8N6C5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
IGSF1Q8N6C5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
IGSF1Q8N6C5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
IGSF1Q8N6C5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
IGSF1Q8N6C5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
IGSF1Q8N6C5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
IGSF1Q8N6C5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
IGSF1Q8N6C5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
IGSF1Q8N6C5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
IGSF1Q8N6C5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
IGSF1Q8N6C5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
IGSF1Q8N6C5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
IGSF1Q8N6C5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
IGSF1Q8N6C5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
IGSF1Q8N6C5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
IGSF1Q8N6C5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
IGSF1Q8N6C5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms