Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
PPARGC1BQ86YN6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PPARGC1BQ86YN6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PPARGC1BQ86YN6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PPARGC1BQ86YN6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PPARGC1BQ86YN6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PPARGC1BQ86YN6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
PPARGC1BQ86YN6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PPARGC1BQ86YN6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PPARGC1BQ86YN6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PPARGC1BQ86YN6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
PPARGC1BQ86YN6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
PPARGC1BQ86YN6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PPARGC1BQ86YN6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PPARGC1BQ86YN6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PPARGC1BQ86YN6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PPARGC1BQ86YN6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PPARGC1BQ86YN6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
PPARGC1BQ86YN6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
PPARGC1BQ86YN6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PPARGC1BQ86YN6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PPARGC1BQ86YN6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PPARGC1BQ86YN6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PPARGC1BQ86YN6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PPARGC1BQ86YN6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PPARGC1BQ86YN6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
PPARGC1BQ86YN6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PPARGC1BQ86YN6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PPARGC1BQ86YN6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PPARGC1BQ86YN6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PPARGC1BQ86YN6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PPARGC1BQ86YN6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PPARGC1BQ86YN6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PPARGC1BQ86YN6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PPARGC1BQ86YN6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PPARGC1BQ86YN6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PPARGC1BQ86YN6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PPARGC1BQ86YN6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PPARGC1BQ86YN6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PPARGC1BQ86YN6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PPARGC1BQ86YN6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PPARGC1BQ86YN6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PPARGC1BQ86YN6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
PPARGC1BQ86YN6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PPARGC1BQ86YN6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
PPARGC1BQ86YN6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
PPARGC1BQ86YN6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
PPARGC1BQ86YN6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
PPARGC1BQ86YN6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PPARGC1BQ86YN6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PPARGC1BQ86YN6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PPARGC1BQ86YN6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
PPARGC1BQ86YN6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PPARGC1BQ86YN6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PPARGC1BQ86YN6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PPARGC1BQ86YN6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PPARGC1BQ86YN6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PPARGC1BQ86YN6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PPARGC1BQ86YN6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PPARGC1BQ86YN6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PPARGC1BQ86YN6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PPARGC1BQ86YN6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PPARGC1BQ86YN6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PPARGC1BQ86YN6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PPARGC1BQ86YN6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms